sábado, 1 de dezembro de 2018

Princípios da geometria química subjacente à seletividade quiral na aminoacilação da mini hélice do RNA

A origem da homoquiralidade no L-aminoácido nas proteínas é um dos mistérios da evolução da vida. Estudos experimentais mostram que uma reação de aminoacilação não enzimática de uma mini-hélice de ARN tem uma preferência pelo L-aminoácido relativamente ao D-aminoácido.

 A reação inicia aproximando-se de um oxigénio 3 'da mini-hélice de ARN ao carbonilo de um oligonucleótido aminoacil fosfato. Aqui, empregando simulações de dinâmica molecular, examinamos os possíveis mecanismos que determinam essa seletividade quiral. O sistema de simulação adotou uma geometria necessária para que a reação química ocorresse mais freqüentemente com a L-alanina do que com a D-alanina. 

Para a L-alanina, a estrutura com esta geometria foi formada por uma combinação de ângulos diédricos estáveis ​​ao longo do esqueleto de fosfato de alanilo com uma estrutura de RNA canônico, onde o grupo metil da alanina foi colocado no lado oposto do grupo 3'-hidroxila com em relação ao plano de carbonila.

 Para o D-alanina, o grupo meti Io e o grupo 3'-hidroxilo foram colocadas no mesmo lado em relação ao plano de carbonilo, que diminuiu significativamente a sua capacidade de se aproximar 3'-oxigénio perto do carbono carbonilo em comparação com a L-alanina. O mecanismo aqui sugerido pode explicar as preferências quirais observadas experimentalmente.


Nota: Acho fantástico o estudo dos quirais na química. Quando leio uma matéria como esta sempre me pergunto: tudo isso é um mero acaso, fortuita necessidade ou obra de um Design Inteligente? [FN]

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