terça-feira, 22 de janeiro de 2013

Dados ausentes significam lacunas na Árvore da Vida de Darwin

"Dos 6.193 artigos que entrevistamos em mais de 100 revistas peer-reviewed, apenas 17% apresentam árvores acessíveis e alinhamentos (utilizado para inferir parentesco). Contato com autores importantes para obter conjuntos de dados foi de apenas 19% de sucesso. Seqüências de DNA foram depositados no GenBank para quase todos esses estudos, mas são os alinhamentos de personagens reais que são fundamentais para a reprodução de análises filogenéticas. Estimamos que mais de 64% dos alinhamentos existentes ou árvores são perdidos para sempre. (grifo nosso)

Este problema irá dificultar cada vez mais a inferência filogenética como o uso de genoma inteiro conjuntos de dados torna-se comum. Revistas necessidade de reforçar uma política de deposição de dados on-line, seja como material suplementar ou em repositórios como TreeBASE (http://treebase.org) ou Dryad (http://datadryad.org) - inclusive para conjuntos de dados com base no anteriormente sequências publicadas. Ecologistas, biólogos evolucionários e outros, então, ter acesso a filogenia rigorosos para testar suas hipóteses.

Fonte:Desafiando a Nomenklatura Científica

Nota do blog Desafiando a Nomenklatura Científica: Quase 4.000 (quatro mil) artigos onde as pesquisas não podiam ser corroboradas no contexto de justificação teórica, e Drew reconhece que o problema é sério: mais de 64% dos dados filogenéticos estão perdidos.Quase 4.000 (quatro mil) artigos onde as pesquisas não podiam ser corroboradas no contexto de justificação teórica, e Drew reconhece que o problema é sério: mais de 64% dos dados filogenéticos estão perdidos.

Pelo menos é isso o que alguns cientistas na comunidade filogenética argumentar, porque apenas cerca de quatro por cento de todos os filogenias publicados estão armazenados em locais como TreeBASE ou Dríade. Sua mensagem é muito simples: é hora de reunir mais bancos de dados com estimativas sobre como as espécies estão possivelmente relacionados entre si.

Vários periódicos no campo da biologia evolutiva, recentemente adoptado políticas que motivem ou exijam contribuintes fazerem seus dados on-line disponível publicamente. No entanto, isso só leva para o armazenamento de uma percentagem muito pequena de dez milhares de filogenias que foram construídos nas últimas décadas.


Quer dizer então que a hipótese de ancestral comum/descendência com modificação precisa ser cientificamente considerada cum grano salis??? Meio copo cheio, meio copo vazio??? Vide artigo Small portion of phylogenetic data is stored publicly - ‘The glass is still pretty empty’ do Open Tree of Life:

"Às vezes você quer saber se o copo está meio cheio ou meio vazio. Mas quando ela é preenchida apenas para quatro por cento - 96 por cento do outro é apenas o ar - não é apenas uma conclusão: é tempo para mais."

Queria ver a cara de alguns mandarins da Nomenklatura científica e da Galera dos meninos e meninas de Darwin... A Árvore da Vida é uma ilusão... projeção de mentes mesmerizadas pelo materialismo filosófico que não se rendem às evidências encontradas na natureza...

O bom é que a ciência é a busca pela verdade das evidências. Os cietistas devem segui-las aonde elas forem dar.



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